[UNDER EMBARGO] Protist community DNA metabarcoding

UNDER EMBARGO - This dataset is part of BE/2023 sampling campagn in SW Greenland fjords (Igaliku and Tunulliarfik). Samples for DNA extraction were collected along fjord transects at several depths of the water column. The focus of the study was to determine the taxonomical composotion of protist community in two Arctic fjords.

Datumsangaben (Erstellung) Date (Création) Datum (creatie) Date (Creation): 2026-06-16

Datumsangaben (Überarbeitung) Date (Révision) Datum (revisie) Date (Revision): 2026-10-21

Datumsangaben (Publikation) Date (Publication) Datum (publicatie) Date (Publication): 2026-10-21

Title: Digital Object Identifier

Datumsangaben (Erstellung) Date (Création) Datum (creatie) Date (Creation): 2016-05-19

Code: https://doi.org/10.24417/bmdc.be:dataset:3144

Identifikator Identificateur Identifier Citation identifier: http://metadata.naturalsciences.be / bmdc.be:dataset:3144
Belgian Marine Data Centre

Point of contact

Organisation name	Electronic mail address	Role
Royal Belgian Institute of Natural Sciences (RBINS), Directorate Natural Environment (OD Nature), Belgian Marine Data Centre (BMDC) Institut royal des Sciences naturelles de Belgique (IRSNB), Direction opérationnelle Milieux naturels (DO Nature), Belgian Marine Data Centre (BMDC) Koninklijk Belgisch Instituut voor Natuurwetenschappen (KBIN), Operationele Directie Natuurlijk Milieu (OD Natuur), Belgian Marine Data Centre (BMDC) Königliches Belgisches Institut für Naturwissenschaften (KBIN), Operationelle Direktion Natürliche Umwelt (OD Natur), Belgian Marine Data Centre (BMDC)	bmdc@naturalsciences.be	Verwalter Gestionnaire beheerder Custodian
Royal Belgian Institute of Natural Sciences (RBINS) Institut royal des Sciences naturelles de Belgique (IRSNB) Koninklijk Belgisch Instituut voor Natuurwetenschappen (KBIN) Königliches Belgisches Institut für Naturwissenschaften (KBIN) Natur)	info@naturalsciences.be	Eigentümer / Datenherr Propriétaire eigenaar Owner
Royal Belgian Institute of Natural Sciences (RBINS) Institut royal des Sciences naturelles de Belgique (IRSNB) Koninklijk Belgisch Instituut voor Natuurwetenschappen (KBIN) Königliches Belgisches Institut für Naturwissenschaften (KBIN) Natur)	info@naturalsciences.be	Herausgeber Editeur (publication) uitgever Publisher

Keywords

Greenland
nanopore
fjord
protist
Reporting INSPIRE

Reporting INSPIRE

Reporting INSPIRE

Reporting INSPIRE
Federal government

Federale Overheid

Gouvernement Fédéral

Bundesregierung

GEMET - Concepts, version 4.2.3

GEMET - Concepts, version 4.2.1

marine environment

Nutzungseinschränkungen Contraintes d'utilisation (Juridische) gebruiksbeperking Use constraints: Benutzerdefinierte Einschränkungen

Autres restrictions

anders

Other restrictions

Other constraints: No conditions apply to access and use

Other constraints: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Zugriffseinschränkungen Contraintes d'accès (Juridische) toegangsrestrictie Access constraints: Benutzerdefinierte Einschränkungen

Autres restrictions

anders

Other restrictions

Other constraints Overige beperkingen Autres contraintes Andere Einschränkungen: No limitations on public access.

Geen beperkingen op openbare toegang.

Pas de restrictions concernant l'accès public.

Öffentliche Zugang nicht beschränkt.

Use limitation Gebruiksbeperkingen Limitation d'utilisation Anwendungseinschränkungen: No conditions apply to use.

Geen voorwaarden in verband met gebruik.

Aucune condition ne s'applique à l'utilisation.

Es gelten keine Bedingungen zum Nutzung.

Sicherheitseinstufung Restrictions de manipulation Veiligheidsrestricties Classification: Unbeschränkt

Non classifié

vrij toegankelijk

Unclassified

Räumliche Darstellungsart Type de représentation spatiale Ruimtelijk schema Spatial representation type: Text, Tabelle

Tabulaire

tekstTabel

Text, table

Sprache Langue de la ressource Taal Language: English

ISO-Thematik Catégorie ISO Onderwerp Topic category

Meere

Océans

oceanen

Oceans

gml32:beginPosition: 2023-07-17

gml32:endPosition: 2023-07-31

Identifikator des Referenzsystems Nom du système de référence Referentiesysteem identifier Reference system identifier: http://www.opengis.net/def/crs/EPSG/0/4258

Digitale Transferoptionen

Options de transfert numérique

Digitale leverings opties

Digital transfer options

OnLine resource

Protocol	Linkage	Name
DOI	https://doi.org/10.24417/bmdc.be:dataset:3144	Digital Object Identifier (DOI)

Bezugsebene Niveau Niveau kwaliteitsbeschrijving Hierarchy level: Datenbestand

Jeu de données

dataset

Dataset

Konformitätsergebnis

Résultat de conformité

Resultaat conformiteit met de specificatie

Conformance result

Title Titel Spécification Titel: COMMISSION REGULATION (EU) No 1089/2010 of 23 November 2010 implementing Directive 2007/2/EC of the European Parliament and of the Council as regards interoperability of spatial data sets and services

Verordening (EU) n r. 1089/2010 van de Commissie van 23 november 2010 ter uitvoering van Richtlijn 2007/2/EG van het Europees Parlement en de Raad betreffende de interoperabiliteit van verzamelingen ruimtelijke gegevens en van diensten met betrekking tot ruimtelijke gegevens

Règlement (UE) N° 1089/2010 de la Commission du 23 novembre 2010 portant modalités d'application de la directive 2007/2/CE du Parlement européen et du Conseil en ce qui concerne l'interopérabilité des séries et des services de données géographiques

Verordnung (EG) Nr. 1089/2010 der Kommission vom 23. November 2010 zur Durchführung der Richtlinie 2007/2/EG des Europäischen Parlaments und des Rates hinsichtlich der Interoperabilität von Geodatensätzen und -diensten

Datumsangaben (Publikation) Date (Publication) Datum (publicatie) Date (Publication): 2010-12-08

Explanation Uitleg Explication Erklärung: See the referenced specification

Zie de gerefereerde specificatie

Voir la spécification référencée

Siehe die angegebene Spezifikation

Bestanden Degré de conformité Indicatie van conformiteit met de specificatie Pass: Yes

Statement: Seawater samples (500 mL) were prefiltered (100 µm) and filtered onto 0.22 µm membrane filters, then stored at −80 °C. DNA was extracted using the DNeasy PowerLyzer Microbial Kit (Qiagen) following the manufacturer’s protocol, including negative extraction controls. The V4 region of the 18S rRNA gene was amplified using the TAReuk454FWD1 and TAReukREV3 primers (Stoeck et al., 2010). Amplicon libraries were sequenced on an Illumina MiSeq platform (2 × 300 bp). Sequence data were processed using the DADA2 pipeline (v.1.14.1) in R. Primers were removed, and reads were quality filtered, trimmed, and truncated (forward reads at 280 bp). Amplicon Sequence Variants (ASVs) were inferred after dereplication and error learning, and chimeras were removed. Due to low quality of reverse reads, only forward reads were retained for downstream analyses. Taxonomic assignment was performed against the PR2 database (v.5.0.0) with a minimum bootstrap confidence of 98%. Subsequent processing (phyloseq) included removal of non-eukaryotic sequences, Metazoa, unassigned ASVs, and potential contaminants (>1% in negative controls).

Metadata

Metadatensatzidentifikator Identifiant de la fiche Metadata ID File identifier: bmdc.be:dataset:3144 XML

Sprache Langue Taal Metadata language: English

Zeichensatz Jeu de caractères Karakterset Character set: Utf8

Utf8

utf8

UTF8

Hierarchieebene Type de ressource Hierarchisch niveau Hierarchy level: Datenbestand

Jeu de données

dataset

Dataset

Datum Date des métadonnées Metadata datum Date stamp: 2026-10-21T16:13:48.458Z

Metadata standard name: Geographic information -- Metadata

Metadata standard version: ISO 19115:2003/19139

Metadata author

Organisation name	Individual name	Electronic mail address	Role
Royal Belgian Institute of Natural Sciences (RBINS), Directorate Natural Environment (OD Nature), Belgian Marine Data Centre (BMDC) Institut royal des Sciences naturelles de Belgique (IRSNB), Direction opérationnelle Milieux naturels (DO Nature), Belgian Marine Data Centre (BMDC) Koninklijk Belgisch Instituut voor Natuurwetenschappen (KBIN), Operationele Directie Natuurlijk Milieu (OD Natuur), Belgian Marine Data Centre (BMDC) Königliches Belgisches Institut für Naturwissenschaften (KBIN), Operationelle Direktion Natürliche Umwelt (OD Natur), Belgian Marine Data Centre (BMDC)		bmdc@naturalsciences.be	Ansprechpartner Point de contact contactpunt Point of contact

Other language

Language	Character encoding
Deutsch Allemand Duits German
Französisch Français Frans French
Niederländisch Néerlandais; flamand Nederlands; Vlaams Dutch; Flemish
Englisch Anglais Engels English

Overviews

Spatial extent

Provided by

Access to the catalogue

Read here the full details and access to the data.

Simple

Digitale Transferoptionen Options de transfert numérique Digitale leverings opties Digital transfer options

Konformitätsergebnis Résultat de conformité Resultaat conformiteit met de specificatie Conformance result